تیپ بندی هلیکوباکترپیلوری از گروه های قومی مختلف در ایران از طریق تعیین توالی لوکوس های مختلف (mlst)

پایان نامه
چکیده

هلیکوباکترپیلوری در معده انسان کلنیزه شده و برای دهه های متمادی باقی می ماند. پراکندگی های باکتریایی می تواند مهاجرت های انسانی قدیمی و اخیر را آشکار کند. در این مطالعه تیپ بندی سویه های هلیکوباکترپیلوری از 147 ایرانی در سراسر ایران که خاستگاه قومی- جغرافیایی برای آن ها به خوبی مشخص شده بود، با استفاده از روشmulti-locus sequence typing انجام شده و برای هر سویه الگوی هاپلوتایپی تعریف شد. سپس توالی های ژن های مرکزی سویه های ایرانی با توالی های بدست آمده از سویه های دیگر در نقاط مختلف جهان مقایسه شد. سویه های هلیکوباکترپیلوری از جمعیت ایرانی مشابه سویه های جدا شده از جمعیت اروپا- آسیایی غربی بود و از این رو می تواند در درون جمعیت hpeurope که قبلا توصیف شده واقع شود. علی رغم موقعیت جغرافیایی ایران که در تقاطع اروپا- آسیا واقع شده، در این مطالعه مدرکی که ایران به عنوان منبع عمده نیایی برای سویه ها در قاره اروپا- آسیا باشد، یافت نشد. در مقیاس کوچکتر، خویشاوندی ژنتیکی نزدیک مابین سویه های هلیکوباکترپیلوری جدا شده از گروه های قومی ایرانی اختصاصی و سویه های مشابه به لحاظ قومی یا جغرافیایی در کشورهای همسایه مشاهده شد. براین اساس وضعیت هلیکوباکترپیلوری در ایران به شدت تحت تاثیر مبادله ژنتیکی با کشورهای همسایه بوده و تمایز قومی- جغرافیایی سویه ها در درون کشور به خوبی حفظ شده است. این یافته ها برخلاف آنالیزهای قبلی بر اساس mtdna و کروموزوم y انسانی می باشد که علی رغم تعداد نمونه بالا و تعداد بیشتر مکان های جغرافیایی همسایه نمونه برداری شده، نتوانستند ارتباط های واضح مشابهی را نشان دهند. قدرت تفکیک بالاتر هلیکوباکترپیلوری برای تشخیص الگوهای منطقه ای، از جمله الگوهای اخیر حرکت جمعیتی، نتیجه انتقال آهسته باکترهای بین گروه های قومی و سرعت بالای تکامل توالی های آن در مقایسه با dna انسانی می باشد.

منابع مشابه

تیپ بندی موتیف های انتهای کربوکسیلی پروتئین caga هلیکوباکترپیلوری از نواحی جغرافیایی مختلف در ایران

caga یک پروتئین باکتریایی 120 تا 145 کیلو دالتون است که نقش بسیار مهمی در بروز بیماری¬های گوارشی دارد و باعث افزایش خطر ابتلا به بیماری¬های زخم معده، آتروفی معده و سرطان معده می¬شود. پروتئین caga دارای ناحیه¬ی تکرارپذیر epiya (گلوتامین- پرولین- ایزولوسین- تیروزین-آلانین) بسیار پلی¬مورف در ناحیه¬ی انتهای کربوکسیلی می¬باشد. هدف از این مطالعه تعیین تعداد و انواع موتیف epiya در ناحیه¬ی متغیر 3 از م...

15 صفحه اول

تیپ بندی آلل های ژن icea و baba هلیکوباکترپیلوری از مناطق جغرافیایی مختلف در ایران

هلیکوباکترپیلوری نقش بسیار مهمی در بروز بیماری های گوارشی مانند التهاب مزمن معده، زخم معده، لنفوم malt و سرطان معده دارد. هدف از این مطالعه بررسی احتمال وجود تفاوت در پروفایل های آللی شناخته شده ژن های بیماری زای هلیکوباکترپیلوری در مناطق جغرافیایی مختلف ایران بویژه نواحی با میزان بروز بالا و پایین سرطان معده و بررسی احتمال وجود گرادیان شمال-جنوب در فراوانی آلل های این ژن ها در ایران می باشد. د...

تیپ بندی آلل های ژن vaca هلیکوباکترپیلوری از مناطق جغرافیایی مختلف در ایران

چکیده هلیکوباکترپیلوری نقش بسیار مهمی در بروز بیماری های گوارشی مانند التهاب مزمن معده، زخم معده، لنفوم malt و سرطان معده دارد. هدف از این مطالعه بررسی احتمال وجود تفاوت در پروفایل های آللی شناخته شده ژن-بیماری زایvaca هلیکوباکترپیلوری در مناطق جغرافیایی مختلف ایران بویژه نواحی با میزان بروز بالا و پایین سرطان معده و بررسی احتمال وجود گرادیان شمال-جنوب در فراوانی الل های ژن بیماری زایvaca هلی...

15 صفحه اول

مقایسه آزمون های مختلف در تشخیص هلیکوباکترپیلوری

سابقه و هدف: با توجه به شیوع بالای اختلالات گوارشی و نقش عمده هلیکوباکترپیلوری در بروز گاستروآنتریت، زخم اثنی عشر و آدنوکارسینومای معده و عدم وجود یک روش استاندارد طلایی مورد پذیرش عموم و به منظور مقایسه آزمون های تهاجمی و غیر تهاجمی جهت تشخیص عفونت هلیکوباکترپیلوری این تحقیق بر روی مراجعه کنندگان به بیمارستان شهید بهشتی کاشان در سال 1379 انجام گرفت. مواد و روش ها: پژوهش حاضر با روش کارآزمایی ب...

متن کامل

گروه بندی سویه های مختلف باکتری اشرشیا کلی با استفاده از تعیین PCR و مقایسه آن با روش مولتی پلکس thrB توالی ژن

Background and purpose: The best-known groups of Escherichia coli are B2, B1, A, and D. Previous studies have clearly shown the difference between this group such as resistance to antibiotics, the growth rate, and pathogenicity. Therefore, identifying different groups of E. coli could be of great benefit in curing infections caused by this bacterium. There are some defects in traditional dia...

متن کامل

گروه بندی ژنوتیپ های یونجه از نظر صفات مختلف با استفاده از روش های آماری چند متغیره

In order to analyze genetic diversity and determine the most effective characteristics on seed yield, 49 alfalfa genotypes including foreign and Iranian germplasms, were evaluated using a simple lattice design with two replications in researches station of Natural Resources and Agricultural Research Center of East Azerbaijan province. Analysis of variance revealed significant genetic diversity ...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک وزیست فناوری

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023